《回到古代当药神》讲述现代医药学天才林羽，一次意外穿越到古代。刚到古代，他便遭遇当地恶霸欺压百姓，还碰上瘟疫横行，百姓苦不堪言，当地郎中对此束手无策。林羽凭借现代医学知识，迅速研制出治疗瘟疫的药方，拯救了众多百姓，声名远扬。 他在古代开医馆，一边治病救人，一边研究古代草药特性，将现代医学与古代医术相结合。在此过程中，他结识了善良的千金小姐柳瑶，柳瑶钦佩他的医术与为人，二人渐生情愫。然而，他的成就引来了同行嫉妒与奸人陷害，医馆被封，他也身陷囹圄。但林羽凭借智慧与医术证明自己的清白，最终成为一代药神，与柳瑶过上幸福生活。