《神医签到365天》围绕主角展开一段充满奇幻色彩的神医之旅。主角本是平凡之人，意外开启了神医签到系统，只要连续签到365天就能获得无上的神医能力。在签到的过程中，他不断面临各种挑战。先是遇到一位身患怪病的富商，富商的病情复杂，众多名医都束手无策。主角凭借签到获得的初级医术知识，大胆尝试独特疗法，成功治愈富商，从而声名鹊起。然而，这也引来了同行的嫉妒和刁难。随着签到天数的增加，主角的医术越发精湛，他又卷入了一场宫廷的医疗危机，凭借高超医术化解难题，在这个过程中收获了友情、爱情，也一步步朝着365天的签到目标迈进。